熊本YMCA的日語教育始於1979年，通過日語教育為世界人民和日本國民提供了一個相互交流和理解的場所。1990年被(財)日語教育振興協會認定後,設立了日語學院。於2007年4月順利地從財團法人過渡為學校法人。熊本YMCA的學生畢業後，通過所掌握的日語能力，進入到日本各個大學、大學院繼續深造，或者是活躍在國際舞臺上。熊本YMCA學院不但教給學生升學所需的高水準日語能力，還以建立多文化共存以及為各國青少年提供相互間加深歷史、文化理解的場所而努力。